ASF1B在肾透明细胞癌中的表达及临床意义

作者：郑天云; 孙井涛; 崔浩辰; 阎磊^*

来源：泌尿外科杂志(电子版), 2023, 15(02): 28-36.

DOI：10.20020/j.CNKI.1674-7410.2023.02.07

• 生物信息学
• 肾透明细胞癌
• ASF1B
• 基因突变
• 甲基化
• 生物标志物

目的 探讨ASF1B基因在肾透明细胞癌患者中的表达水平及对临床预后的意义。方法 通过在肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)及UCSC Xena数据库下载并分析肾透明细胞癌基因表达数据共607例,其中正常肾组织及癌旁组织数据72例,肾透明细胞癌数据535例。明确ASF1B基因在肾透明细胞癌组织与正常组织间的表达差异,分析ASF1B表达与患者生存时间的相关性。使用生信线上工具(GEPIA、cBioPortal、STRING以及TIMER)探究肾透明细胞癌患者ASF1B表达与基因突变及甲基化水平相关性,研讨其与肿瘤免疫微环境的相互作用,探讨ASF1B对肾透明细胞癌的预测能力。结果 ASF1B基因在肾透明细胞癌细胞中表达水平明显高于正常肾组织中的表达水平(P=2.22e-16);ASF1B基因高表达组的患者生存周期明显低于ASF1B基因低表达组(P=0.024)。ASF1B基因在经过多因素回归分析(P<0.001)后可确定为肾透明细胞癌的高风险独立预后因子。ASF1B基因突变水平无法作为患者预后的诊断指标;cg06969527甲基化位点的甲基化程度与基因表达呈负相关(P=0.0048,HR=-0.16)。ASF1B基因表达水平与CD4+T细胞表达水平呈负相关(P=5.89e-1,Rho=-0.025),与CD8+T细胞表达水平呈正相关(P=2.04e-10,Rho=0.29),与CD2基因表达水平呈正相关(P=2.47e-21,Rho=0.395),与CD3D基因表达水平呈正相关(P=9.54e-22,Rho=0.399),与CD3E基因表达水平呈正相关(P=1.58e-20,Rho=0.387)。结论 ASF1B基因与肾透明细胞癌患者的不良预后有关,可以作为肾透明细胞癌的独立危险因素。

• 单位
  山东大学齐鲁医院