艰难梭菌数字化聚合酶链反应-核糖体分型方法及参考图谱的建立

作者:肖克林; 王中兴; 周天祥; 麦光兴; 王秦宁; 孔繁荣
来源:中华传染病杂志, 2016, 34(02): 111-114.
DOI:10.3760/cma.j.issn.1000-6680.2016.02.011

摘要

目的建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体分型方法及常见基因型的参考图谱。方法利用荧光毛细管电泳技术代替琼脂糖凝胶电泳检测艰难梭菌PCR-核糖体分型产物,建立数字化PCR-核糖体分型方法;利用40株分属于10种核糖体型(RT)的艰难梭菌参考菌株构建常见基因型的数字化参考图谱。结果荧光毛细管电泳技术准确地检测出40株艰难梭菌参考菌株的PCR核糖体分型片段,并以数字化的形式呈现,10种核糖体型艰难梭菌的PCR-核糖体分型数字化图谱差异明显。同为RT027的21株菌株间、RT002的3株菌株间和RT015的2株菌株间的数字化分型结果相似性都非常高,而7株RT001菌株则可分为4种亚型,2株RT014分为2种亚型。结论成功建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体分型方法,同时构建了艰难梭菌10种核糖体型的数字化PCR核糖体分型参考数据库。

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