青鱼生长相关SNP标记在不同地理群体中的验证

作者：郭加民; 徐晓雁; 李家乐; 沈玉帮^*

来源：上海海洋大学学报, 2022, 31(05): 1089-1096.

• 青鱼
• SNP
• 遗传多样性
• 中性检验

单核苷酸多态性分子标记(single nucleotide polymorphism, SNP)是目前常用的分子标记辅助育种的工具之一。本研究在前期构建的青鱼(Mylopharyngodon piceus)高密度连锁图谱和QTL定位结果的基础上，利用体质量QTL区间中的2个SNP标记在3个青鱼群体中进行验证，目的是为了检测通过QTL定位得到的SNP是否存在并能应用于其他地理群体，利用对分子标记的侧翼序列进行基因型组成分析、遗传多样性分析及中性检验等方法，对3个群体的2个SNP侧翼序列进行分析。遗传多样性结果显示，snp8107的扩展片段的单倍型多样性(Hd)在邗江群体、湘江群体和石首群体中分别为0.782、0.515和0.497;各位点的观测杂合度(H0)为0.067～0.533,平均为0.239;期望杂合度(He)为0.127～0.506,平均为0.306;多态信息含量(PIC)为0.117～0.374,平均为0.246。中性检验显示3个群体在历史上可能发生过瓶颈效应导致稀有等位基因丢失的现象，结合遗传多样性结果推测，邗江群体在经历瓶颈效应后保留下来的稀有等位基因更多，最终得出结论邗江群体是适合进行遗传改良的最优群体。

• 单位
  上海海洋大学