藜麦脂肪酸转运基因家族FAX的鉴定与表达分析

作者：时小东; 孙梦涵; 吴琪; 田银帅; 徐莺^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(12): 5652-5659.

DOI：10.13417/j.gab.039.005652

• 藜麦
• 脂肪酸转运
• 基因家族

藜麦是唯一一种单体植物即可满足人体基本营养需求的食物,其籽粒脂肪酸含量丰富、组成合理。植物脂肪酸转运蛋白FAX对介导质体中脂肪酸向外运输过程中发挥着重要的作用。本研究基于藜麦基因组序列信息,对藜麦FAX基因家族进行全基因组鉴定,并对该家族成员的基因结构、染色体定位、蛋白结构和表达模式等进行了全面分析,为进一步了解该家族功能和培育油用藜麦品种提供理论支撑。结果表明,藜麦FAX基因家族包含10个成员,分布在8条染色体上,8个CqFAX基因包含内含子和外显子;蛋白序列对比结果显示藜麦CqFAX蛋白之间氨基酸序列保守性较低,只有少数氨基酸残基具有保守性,可能对于FAX蛋白功能发挥关系密切;大多数CqFAX含有4个α螺旋,与其三级空间结构相似;进化树分析表明CqFAX蛋白分为4枝,与基因结构关系基本保持一致。对转录组表达数据分析表明,CqFAX基因在藜麦不同组织中均存在表达,其中AUR62006421、AUR62017596、AUR62026084和AUR62029770在种子中表达水平较高,可能在种子脂肪酸形成和积累中发挥着重要作用。

• 单位
  四川大学; 生物工程学院; 成都大学; 生命科学学院