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摘要
为制定野桑蚕全基因组denovo测序策略及分析不同地理来源的野桑蚕(Bombyx mandarina)、家蚕(Bombyx mori)之间的亲缘关系，利用Illumina Hiseq 2500测序平台对单只雌性秦巴山区野桑蚕基因组进行Survey调研，分析基因组大小、杂合度、GC含量等基本信息，对基因组进行初步组装；从测序数据中提取并组装线粒体基因组，基于其分析家蚕、野桑蚕的系统进化关系。结果获得测序clean data 25.8 Gb，基因组预估大小为456.5 Mb，杂合率为1.94%；基因组预组装结果 Scaffold N50为1 792 bp,Scaffold数量为737 055;Contig N50为587 bp,Contig数量为1 477 268。线粒体组装和注释表明，野桑蚕线粒体长度为15 662 bp，包含基因37个，没有发生基因重排；系统进化分析表明，中国野桑蚕总体上可构成2个以地理来源区分的南北群体，其中北方野桑蚕群体与家蚕亲缘关系最为接近。本研究表明，野桑蚕基因组杂合率较高，后续需综合利用第二代、三代测序方法，辅以Hi-C技术，才能组装获得高质量的野桑蚕基因组图谱，同时本研究支持了家蚕驯化起源于中国北方的观点，表明陕南秦巴山区可能是家蚕的驯化起源地之一。
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