枇杷MADS-box全基因组鉴定及其在果实成熟过程中的潜在作用

作者：刘楠; 寇燕; 李小婷; 陈旭; 高欢欢; 张晶; 王超; 郑嘉敏; 郑国华^*

来源：福建农林大学学报（自然科学版）, 2022, 51(03): 351-360.

DOI：10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2022.03.008

• 枇杷
• 全基因组
• MADS-box基因
• 果实成熟

利用生物信息学方法，从全基因组水平鉴定枇杷MADS-box基因家族成员，并对其系统进化关系、保守结构域、基因结构、基因复制和启动子顺式作用元件进行分析；同时，结合转录组数据和qRT-PCR结果，分析鉴定出的MADS-box基因家族成员在不同品种和不同成熟阶段的表达情况.本研究共鉴定出89个枇杷MADS-box基因(命名为EjMADS1～EjMADS89),其N端都含有MADS结构域.系统发育树显示，Ⅰ型MADS-box基因有31个，Ⅱ型有58个.Ⅱ型MADS-box基因可划分为14个亚族，同属于一个亚家族的基因有着相似的保守基序.MADS-box基因以不同密度分布在第1～17号染色体上，存在12对串联重复基因.转录组分析表明，在果实成熟过程中，有8个MADS-box基因在果实成熟期间差异表达，其中，EjMADS26、EjMADS43和EjMADS41这3个基因序列分别与其他调控果实成熟的SEP亚族基因高度相似，且它们的启动子中都含有赤霉素和脱落酸响应元件.另外，EjMADS37和EjMADS05在不同品种间(特早熟/中晚熟)有明显表达差异.综上，推测EjMADS26、EjMADS43、EjMADS41、EjMADS37和EjMADS05对果实成熟有一定的调控作用.

• 单位
  福建农林大学