不同来源金黄色葡萄球菌的全基因组序列分析

作者：陈驰; 石继春; 王春娥; 梁丽; 龙新星; 叶强^*; 徐颖华^*

来源：中国病原生物学杂志, 2022, 17(02): 165-169.

DOI：10.13350/j.cjpb.220208

• 金黄色葡萄球菌
• 不同来源
• 全基因组测序
• 毒力因子
• 耐药基因

目的 了解不同来源金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)的全基因组序列基本特征，探究菌株的分子分型、耐药基因型、毒力及其遗传进化关系。方法 应用solexa高通量测序技术对10株医源性和食源性代表株金葡菌进行全基因组测序，以此进行多位点序列分型(multilocus sequence typing, MLST)、金葡菌a蛋白(Staphylococcus aureus protein A,spa)基因分型分析，并比较分析不同菌株基因组中携带耐药基因和毒力因子，筛选核心基因，构建系统进化树。结果 10株金葡菌染色体基因组大小相似，均为2.7 Mbp,包含有2 486～2 648个基因不等，平均长度约为887 bp。耐药基因注释分析显示9株甲氧西林敏感金葡菌(MSSA)携带的耐药基因少于另一株耐甲氧西林金葡菌(MRSA)。尽管在不同菌株基因组之间的毒力因子数量无显著区别，但不同菌株存在的毒力因子却不同，食品来源金葡菌基因组携带1～4种数量不等的肠毒素基因。进化树分析显示不同来源金葡菌位于不同进化分支，2株为ST8型的MSSA和MRSA进化亲缘性较高，属于同一进化分支内。结论 获得10株不同来源金葡菌的全基因组序列数据，并证实食源性或医院来源金葡菌为了适应不同生存环境，通过不同分子进化机制，获得不同耐药基因和毒力因子，形成菌株特定的分子遗传特征，可为金葡菌的分子流行病学和致病性机制研究提供参考依据。

• 单位
  中国食品药品检定研究院