大豆PHD家族蛋白的全基因组鉴定及表达特征分析

作者：杨珺凯; 沈阳; 才晓溪; 邬升杨; 李建伟; 孙明哲; 贾博为; 孙晓丽^*

来源：作物杂志, 2019, (03): 55-65.

DOI：10.16035/j.issn.1001-7283.2019.03.010

• 大豆
• PHD转录因子
• PHD家族分析
• 表达特征
• 逆境胁迫

PHD(Plant Homeodomain Finger)基因家族编码一类锌指转录因子,广泛参与植物的生长发育和逆境应答过程。通过全基因组鉴定获得了95个大豆PHD家族蛋白。通过共线性分析、进化树构建、基因结构和功能结构域鉴定、GO注释分析、不同组织间和非生物胁迫下表达分析等,获得了大豆PHD家族基因复制、家族进化、保守结构域及基因表达等信息。结果表明,大豆PHD基因在家族进化、基因结构和保守结构域上存在较大变异,可能参与Zn2+结合、DNA结合及表观遗传调控等分子过程,参与调控植物生长发育和逆境应答。这些结果为进一步研究大豆PHD家族在生长发育和逆境应答中的生物学功能提供重要线索。

• 单位
  黑龙江八一农垦大学