大白菜F-BOX基因家族的鉴定与核盘菌诱导应答分析

作者：冯冬林; 钟开勤; 丁玲; 刘美琴

来源：福建农业学报, 2023, 38(03): 294-301.

DOI：10.19303/j.issn.1008-0384.2023.03.005

• 大白菜
• F-BOX基因家族
• 菌核病
• 基因表达

【目的】筛选参与菌核病应答反应的F-BOX基因，为大白菜抗菌核病基因的功能研究及抗病品种的选育提供基础。【方法】基于核盘菌侵染大白菜转录组测序数据，对大白菜F-BOX基因家族进行鉴定，进行亚细胞定位、染色体定位、保守结构域等生物信息学分析。分析F-BOX基因在核盘菌侵染下的差异表达，并采用q-PCR技术检测F-BOX基因在0 h和36 h的表达情况。【结果】共鉴定32个BraF-BOX基因，分子量介于34 751.13～105 942.22Da；亚细胞定位表明，26个F-BOX基因定位在细胞核和细胞质中，6个定位在叶绿体中；系统进化树分析将BraFBOX分为4个亚族；基因结构分析结果表明，每个BraF-BOX家族成员均含有Motif 1，序列中均含有外显子；组织特异性表达分析结果表明在不同大白菜部位，表达量有差异；在核盘菌处理36 h时，q-PCR检测6个基因的相对表达量趋势与转录组数据一致，其中Bra037120、Bra011427、Bra009835等3个基因表达上调，核盘菌侵染时间越长，表达量越大。【结论】综合BraF-BOX基因生物信息学及转录组数据分析，Bra037120、Bra011427、Bra009835基因可能参与大白菜菌核病抗性功能，为后续基因功能研究提供研究基础。

• 单位
  福建农业职业技术学院