新疆环塔里木盆地地区拉合尔钝缘蜱线粒体16S rRNA基因遗传多样性分析

作者:刘明明; 芦星; 王水怡; 刘雨桐; 范士龙; 王金明; 李思媛; 巴音查汗; 刘丹丹; 张伟*
来源:中国病原生物学杂志, 2022, 17(11): 1283-1287.
DOI:10.13350/j.cjpb.221109

摘要

目的 探究新疆环塔里木盆地周边的阿克苏、喀什、吐鲁番、巴音郭楞蒙古自治州(简称巴州)4个地区拉合尔钝缘蜱的遗传多样性及其遗传进化关系,为拉合尔钝缘蜱流行病学调查及蜱媒病的防控奠定基础。方法 基于阿克苏、喀什、吐鲁番、巴州4个地区共47条拉合尔钝缘蜱线粒体16S rRNA基因序列,通过DnaSP 5.0分析核苷酸多样性与单倍型多样性,通过MAGE 11构建单倍型邻接树和单倍型网格图,通过Arlequin 3.5分析群体间的分化情况及变异情况。结果 基于16S rRNA基因共界定了拉合尔钝缘蜱31种单倍型,其中共享单倍型1种,为Hap1,在吐鲁番、阿克苏和巴州3个群体中出现;其余30种为独享单倍型,为Hap2-Hap31。多样性分析显示,拉合尔钝缘蜱4个群体的整体单倍型多样度(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.901和0.01627。单倍型NJ系统树与单倍型网络图显示,4个群体间未形成明显的谱系结构和地理结构。遗传分化指数(Fst)与遗传距离分析显示,4个群体间分化程度较弱,各个群体间遗传距离较近;AMOVA分析显示,4个群体遗传变异主要来自群体内部,群体间变异和群体内变异分别占9.42%和90.58%。结论 新疆环塔里木盆地4个地区拉合尔钝缘蜱属高遗传多样性群体,能适应多种环境;各群体间分化程度较低,群体间无明显的谱系结构,且整个种群经历了长期的发展演化,形成了大而稳定的群体。

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