杨梅品种特异性荧光SSR分子标记数据库构建

作者：巨鹏举; 朱奕凡; 赵岚; 汪国云; 周超超; 颜丽菊; 柴春燕; 焦云; 陈金辉; 郭秀珠; 高中山^*

来源：农业生物技术学报, 2023, 31(10): 2209-2220.

• 杨梅
• 指纹图谱
• SSR
• 品种鉴定
• 聚类分析

我国杨梅(Morella rubra)种质资源丰富，地方品系较多。尽管基于杨梅基因组已开发了大量SSR分子标记，但目前尚未形成一套统一用于杨梅品种资源区分鉴定的分子标记，种质资源遗传特异性数据管理较为混乱。本研究基于已开发的杨梅SSR分子标记及连锁图谱定位，从每个连锁群中选择2个扩增片段长度稳定、重复性好的SSR分子标记，采用荧光标记引物，于DNA测序仪上进行片段分析，构建分子标记数据库，形成区分杨梅资源的统一标准；在此基础上分析杨梅各株系的遗传距离，绘制基于遗传距离的聚类树。结果显示，所选取的16个SSR分子标记在杨梅品系材料中的扩增片段大小存在差异，可用于109个杨梅品种与品系的区分，且不同品种与品系的地理来源与遗传距离的远近存在一定程度上的相关性；以地方主栽品种’荸荠种’、’东魁’、’丁岙’和’安海片早生’为扩增片段大小的标准参照，利用16个SSR分子标记的扩增片段构建109份杨梅资源的指纹图谱；进一步选择多态性信息含量(PIC)较高的5个SSR分子标记，可成功区分85%(94/109)的杨梅材料，显示较高的鉴定效率。本研究为杨梅种质资源管理提供更加高效、可靠的方法和标准。

• 单位
  浙江省亚热带作物研究所; 宁波市农业科学研究院; 浙江大学