牡丹TCP家族基因的鉴定与生物信息学分析

作者：张延召; 罗新; 李会云^*; 段旭佳; 张妍

来源：分子植物育种, 2022, 20(01): 31-37.

DOI：10.13271/j.mpb.020.000031

• 牡丹
• TCP家族基因
• TCP结构域

TCP (Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor)家族基因是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育的过程中具有重要的调控作用。本研究从牡丹转录组数据中鉴定出18个TCP基因,分子量在18 978.32～51 789.56 Da之间,等电点在5.81～9.45之间,TCP家族成员亚细胞定位预测均在细胞核中。牡丹TCP结构域中保守氨基酸的分类与拟南芥相似,系统发育分析结果表明,牡丹TCP蛋白分为两大类,ClassⅠ包含10个TCP成员,ClassⅡ包含8个TCP成员。MEME分析结果显示,在牡丹TCP蛋白中发现了15个保守结构域,其中motif 1为TCP结构域,在所有TCP成员中都存在。同时,对牡丹TCP基因在芽、叶、花瓣、花斑、雄蕊、雌蕊和种子7个组织中的转录水平进行了分析。本研究对牡丹TCP家族基因进行了系统的分析,为进一步开展牡丹功能基因研究及分子育种提供了科学依据。

• 单位
  生命科学学院; 洛阳师范学院