“自顶向下(top-down)”的蛋白质组学——蛋白质变体的规模化鉴定

作者：孙瑞祥; 罗兰; 迟浩; 刘超; 贺思敏

来源：生物化学与生物物理进展, 2015, (02): 101-114.

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• 自顶向下(top-down)&rdquo
• 的蛋白质组学
• 串联质谱技术
• 生物信息学
• 蛋白质鉴定 top-down proteomics
• tandem mass spectrometry
• bioinformatics
• protein identification

高分辨率质谱技术的快速发展使得"自顶向下"的蛋白质组学(top-down proteomics)研究逐渐成熟起来.在完整蛋白质水平上研究蛋白质组可以提供更精准、更丰富的生物学信息,特别是对于蛋白质上发生了多种关联性的翻译后修饰的情况.另外,由于基因突变、RNA可变剪接和大量蛋白质翻译后修饰的存在,同一个基因往往最终会产生多个"蛋白质变体"(proteoform),而要准确地鉴定这些蛋白质变体,也离不开"自顶向下"的蛋白质组学.在蛋白质水平上的分离技术、质谱技术与生物信息学技术是完整蛋白质鉴定最关键的三项技术.高效的分离技术是实现规模化蛋白质变体鉴定的前提,有效的质谱碎裂是提供可靠鉴定的核心,而...

• 单位
  中国科学院计算技术研究所; 中国科学院大学