MassARRAY核酸质谱在结核分枝杆菌检测中的应用价值

作者：李爱芳; 曹俊杰; 杨翰; 张郁; 许优; 党丽云; 崔晓利; 康磊; 任斐; 马进宝; 赵国连; 雷静^*

来源：国际呼吸杂志, 2023, 43(10).

• MassARRAY
• 质谱
• 结核分枝杆菌
• IS6110

目的探讨MassARRAY核酸质谱在结核分枝杆菌(MTB)检测中的应用价值。方法采用MassARRAY检测参考菌株MTB特定基因IS6110和ext-rd9, 测定MassARRAY的最低检出限。本研究为诊断性研究。采用非随机抽样法, 收集西安市胸科医院2022年9月至12月疑似结核病患者呼吸道标本和其他体液或组织标本, 收集经抗酸染色阳性而分枝杆菌菌种鉴定排除MTB的培养阳性物。对患者样本采用MGIT960液体培养法(简称培养法)、实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)法、Gene Xpert/RIF和MassARRAY检测MTB, 比较各方法阳性率。以Gene Xpert/RIF为标准, 对比各方法敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、符合率、Kappa值和受试者工作特征(ROC)曲线下面积。将等量的H37Rv分别与金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌和肺炎链球菌混合, 采用MassARRAY法检测MTB。对经抗酸染色阳性而分枝杆菌菌种鉴定排除MTB的84例培养阳性物进行qPCR和MassARRAY检测。结果共收集肺源性标本126例, 肺外标本92例。MassARRAY检测IS6110基因的最低检出限为10 CFU/ml, 检测ext-rd9基因的最低检出限为10～103 CFU/ml。在218例临床标本中, MassARRAY法阳性率高于qPCR法和Xpert法, 在肺源标本和肺外标本中, 以及培养阳性标本和培养阴性标本中, MassARRAY法阳性率均分别高于qPCR法和Xpert法。在肺源标本中, 以Xpert为标准, MassARRAY法检测MTB敏感度(98.39%)、阴性预测值(98.28%)、符合率(93.65%)和一致性(0.873)高于qPCR法和培养法, 一致性与Xpert法几乎一致, 其ROC曲线下面积(0.937)高于qPCR法和培养法。在肺外标本中, 以Xpert为标准, MassARRAY法检测MTB敏感度(83.78%)和阴性预测值(88.00%)高于qPCR法和培养法, 符合率(81.52%)高于培养法, 一致性(0.624)高于培养法, 与Xpert法高度一致, 其ROC曲线下面积(0.819)高于培养法。H37Rv与细菌混合后, 各组均可检出IS6110和ext-rd9基因。与单独H37Rv组相比, 混合细菌组IS6110和ext-rd9基因检出峰值差异无统计学意义。在84株抗酸染色阳性分离菌株中, 有4例堪萨斯分枝杆菌和1例巴西诺卡菌中检测到了IS6110基因。结论 MassARRAY核酸质谱具有灵敏、准确等特点, 适合对结核病患者进行早期、快速诊断, 在结核病诊断中具有良好的应用前景。

• 单位
  西安市胸科医院; 西安市第五医院