睾丸癌基因表达谱的生物信息学分析

作者：蒋平; 夏伦斌; 钟枝梅; 娄新建; 方妍; 左瑞华^*

来源：中华男科学杂志, 2021, 27(03): 195-200.

DOI：10.13263/j.cnki.nja.2021.03.001

• 睾丸癌
• 基因
• 差异表达
• 生物信息学
• 生存率

目的:分析与睾丸癌生存相关的差异基因,探索其发病机制。方法:从GEO数据库中获取睾丸癌基因表达数据集GSE8607,并使用GEO2R在线工具分析获得睾丸癌差异性表达的基因;使用DAVID网站进行GO和KEGG pathway富集,使用STRING和Cytoscape软件进行睾丸癌相关核心基因筛选,使用Kaplan Meier plotter和GEPIA网站分别对睾丸癌相关核心基因进行生存率和表达量分析。结果:共筛选出591个差异表达基因,其中上调基因216个,主要富集23个生物学过程,8个细胞组成,5个生物功能,7条KEGG pathway通路;下调基因375个,只富集到生物学过程,涉及精子的形成与发育等过程。编码蛋白相互作用网络分析获得32个核心基因,其中C1QB、CCL2、CCR2、GPR183、SELL、LAPTM5、NPY5R、CD28、MMP9等9个基因与生存率密切相关(P<0.05),C1QB、CCL2、CCR2、SELL、LAPTM5、CD28、MMP9等7个基因在睾丸癌组织中高表达(P<0.05),NPY5R在睾丸癌组织中低表达(P<0.05)。结论:发现的8个在睾丸癌组织中差异性表达的基因,可以有效的预测患者的生存率,对癌症的诊断、预防、治疗及抗癌新药的开发具有一定的参考意义。

• 单位
  皖西学院