马氏珠母贝Kelch-like基因的序列及其SNP位点分析

作者：杨创业; 张丞澍; 黄静; 郝瑞娟; 师尚丽; 黄荣莲^*; 周芮; 邱金玉; 颜翼龙; 邓岳文

来源：大连海洋大学学报, 2022, 37(03): 386-393.

DOI：10.16535/j.cnki.dlhyxb.2021-146

• 马氏珠母贝
• Kelch-like基因
• 序列分析
• 表达模式

为了探究马氏珠母贝Pinctada fucata martensii Kelch样基因(Kelch-like)的功能，对Kelch-like基因序列及其SNP位点进行了分析。结果表明：马氏珠母贝Kelch-like序列全长为2 127 bp,其中，5′UTR为58 bp, 3′UTR为44 bp,其开放式阅读框长度为2 025 bp,可编码674个氨基酸；预测其Kelch-like氨基酸序列含有1个BTB结构域、1个BACK结构域和2个Kelch结构域；马氏珠母贝Kelch-like与美洲牡蛎Kelch-like氨基酸序列的一致性最高(35%),其次为虾夷扇贝(32.05%);马氏珠母贝Kelch-like氨基酸序列的BTB、BACK保守性较高，且Kelch具有保守的GG位点；Kelch-like基因在马氏珠母贝边缘膜组织的相对表达量显著高于其他组织(P<0.05),且贝壳损伤后6、12、120 h时该组织中的基因表达量显著上调(P<0.05);马氏珠母贝Kelch-like基因共有56个SNP位点，其中，31个SNP位点为中度多态，其余位点为低度多态；10个SNP位点形成了1个单倍块，为4种单倍型，其中单倍型AATCTGTCGG为优异单倍型，其壳质量性状显著大于单倍型AGCCTACCGA和单倍型AGCCTACTTA(P<0.05)。研究表明，马氏珠母贝Kelch-like可能参与贝壳棱柱层的形成，其单倍型AATCTGTCGG具有作为以壳质量为目标的育种标记的潜力，该结果对于选育具有优良经济性状的马氏珠母贝具有重要意义。

• 单位
  南方海洋科学与工程广东省实验室（湛江）; 广东海洋大学