基于SSR分子标记的核桃种质资源分子身份证构建

作者：马庆国; 宋晓波; 贺君星; 周晔; 黄勇; 张俊佩^*; 裴东

来源：植物资源与环境学报, 2023, 32(02): 1-9.

• 核桃
• 种质资源
• SSR分子标记
• 遗传多样性
• 分子身份证

采用13对SSR引物对54份核桃(Juglans spp.)样本的基因组DNA进行了扩增，对这些引物对应位点的遗传多样性进行了分析；在此基础上，剔除扩增条带缺失超过5%的引物，将剩余引物按照区分率从高到低排序并组合，筛选出能够完全区分供试核桃样本的引物组合；根据筛选出的引物组合中每对引物的扩增结果构建供试核桃样本的分子指纹图谱，并结合各核桃样本的基本信息、选育历史等，利用二维码技术生成每个核桃样本的分子身份证。结果表明：本研究共检测到107个等位基因，供试引物对应位点的观测等位基因数为3～16,均值8.2;有效等位基因数为2.2～7.9,均值4.2;观测杂合度为0.10～0.57,均值0.42;期望杂合度为0.55～0.88,均值0.72;Shannon’s信息指数为0.86～2.36,均值1.60;Nei’s基因多样性指数为0.54～0.87,均值0.72;多态信息含量为0.44～0.86,均值0.68。总体来看，引物WGA04和WGA79对应位点的遗传多样性指数较高。剔除引物WGA331、WGA332和WGA376后，其余引物的区分率为5.56%～24.07%。2对引物组合中，WGA04-WGA70的区分率最高(72.22%),以其为基础组成3对引物组合，其中WGA04-WGA70-WGA79、WGA04-WGA70-WGA202、WGA04-WGA70-WGA89和WGA04-WGA70-WGA01的区分率为100.00%。利用WGA04-WGA70-WGA79构建的分子身份证包含各核桃样本的基础信息和简介。研究结果显示：基于SSR分子标记构建的分子身份证可快速、准确鉴定供试核桃种质资源，并可用于核桃种质资源知识产权保护。

• 单位
  中国林业科学研究院林业研究所; 福建省林业科学研究院