摘要
马铃薯遭遇干旱胁迫时,会导致产量下降、品质降低。用生物信息学的方法,对马铃薯DHN(StDHN)基因家族进行全基因组鉴定,对其理化性质、染色体分布等进行分析,利用荧光定量的方法,对其在干旱胁迫下和不同组织中的表达模式进行分析。结果表明,StDHN基因家族共鉴定出5个家族成员,分布于1号、2号和4号染色体上,理化性质分析表明氨基酸长度为80~243个,分子量为8 544.27~25 121.94 ku,等电点(pI)的范围为5.24~7.38。StDHN蛋白的二级结构基本以无规卷曲为主,延伸链与β-转角的比例相当,仅有PG0009968以α-螺旋为主。对马铃薯DHN基因上游1 500 bp启动子区域顺式作用元件分析发现,DHN基因受到光的调控,平均每个基因中有10.4个光响应元件;还受到脱落酸(PG0015495、PG0003531、PG0009968)、赤霉素(PG0003531)等激素的调控;与逆境胁迫相关的包括低温响应元件(PG0030949、PG0003531、PG0009968)、干旱响应元件(PG0030949)等;生长发育调控元件包括胚乳表达(PG0015495)、种子特异性调控(PG0003531)、分生组织表达(PG0003531、PG0009968)。荧光定量结果发现,DHN基因参与干旱应答响应,也有可能参与马铃薯的生长调控。本研究为马铃薯中的耐旱候选基因研究提供参考。
-
单位河北北方学院