鸭圆环病毒ORF-C1基因的扩增及遗传进化分析

作者：吕振环; 赵莎; 卢凤英; 杨婧; 韩凯凯; 黄欣梅; 赵冬敏; 章丽娇; 吴凤瑶; 刘宇卓; 李银; **涛; 张小飞^*

来源：畜牧与兽医, 2023, 55(05): 63-69.

• 鸭圆环病毒
• ORF-C1基因
• 遗传进化分析

鸭圆环病毒(DuCV)感染能够引起鸭的免疫抑制，引起多种病原的继发性感染，在我国鸭群中广泛流行。为了解DuCV的遗传变异情况，对采自山东、江苏和贵州3个省份的19个鸭场的样品进行了PCR测定，并对DuCV的ORF-C1基因进行测序和遗传进化分析。PCR测定结果显示，19个鸭场中有9个鸭场的样品为DuCV阳性，总体阳性率为47.4%;ORF-C1基因序列测定结果显示，9株DuCV之间的核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为93.4%～100%和82.2%～100%,与NCBI中已公布的DuCV毒株的核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为77.8%～99.5%和71.5%～-99.6%;遗传进化分析显示，9株DuCV全部属于DuCV-1b亚型，其中有7株在同一分支上，与D11-JW-001等韩国毒株遗传距离较近，另外2株则与山东、广西的毒株遗传距离较近；此外，与已公布的毒株相比，9株DuCV都在158位发生了氨基酸突变，由E/D变为L/P。上述结果表明，DuCV-1仍然为我国鸭群中的优势流行基因型，但病毒的基因也在不断地发生变异，应该对其进行持续监测。

• 单位
  江苏省农业科学院