条斑紫菜DnaJ基因家族鉴定及其在环境胁迫下的表达分析

作者：孙斌; 孔凡娜^*; 殷吉强

来源：中国海洋大学学报(自然科学版), 2022, 52(12): 51-61.

DOI：10.16441/j.cnki.hdxb.20210335

• 条斑紫菜
• DnaJ
• 基因家族
• 失水胁迫
• 温度胁迫

针对条斑紫菜(Pyropia yezoensis)DnaJ(PyDnaJ)家族研究相对较少的现状，本研究利用生物信息学方法对PyDnaJ基因家族及其在胁迫条件下的表达模式进行探究，以便为进一步解析条斑紫菜抗逆机制奠定前期工作基础。本研究鉴定出27个DnaJ蛋白(PyDnaJ01～27),并发现：其编码氨基酸数量范围为191～980;大部分DnaJ定位于高尔基体和细胞核；成员的基因结构简单，内含子较少；根据所含结构域不同可分为A、B、C三类；27个成员散布于3条染色体上。其中：PY＿1染色体含DnaJ基因最多(11个);PyDnaJ01和PyDnaJ10为片段重复基因；PY＿2和PY＿3染色体上各有8个DnaJ基因；DnaJ基因启动子区域含有不同数目的胁迫响应元件和植物激素响应元件。系统发生分析表明PyDnaJ蛋白家族可以分成10个亚群。qRT-PCR结果显示，PyDnaJ家族成员在孢子体世代下的表达水平显著高于配子体世代，PyDnaJ家族成员在失水及温度胁迫下具有不同表达模式。

• 单位
  中国海洋大学; 生命学院