蕨类植物质子焦磷酸酶编码基因的鉴定及进化分析

作者：梁靖雯; 王鹏; 叶秀旭; 盖江涛; 白蓓蓓; 李倩; 刘咲頔; 徐诗涛^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(07): 3168-3172.

DOI：10.13417/j.gab.039.003168

• 蕨类植物
• 质子焦磷酸酶
• 结构域
• 进化关系

为了全面鉴定蕨类植物中质子焦磷酸酶(AVP1)编码基因,并构建家族进化关系,本研究首先通过检索PfamA数据库从AVP1蛋白序列中鉴定到了一个保守结构域,在此基础上,结合HMMER和BLAST,从6个物种基因组中鉴定到了18条质子焦磷酸酶家族基因。进化树构建结果表明,在勺叶槐叶萍中没有鉴定到AVP亚家族成员;而在细叶满江红中没有鉴定到AVPL亚家族成员。本研究为今后针对蕨类植物中AVP1基因功能的深入研究提供了基因靶标。

• 单位
  农业部; 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所; 海南大学; 黑龙江八一农垦大学