艰难梭菌TPI蛋白的生物信息学分析

作者：李刚; 赵梅; 马红; 杨丹; 李莎莎; 贾伟^*

来源：中国病原生物学杂志, 2023, 18(07): 765-776.

DOI：10.13350/j.cjpb.230704

• 艰难梭菌
• TPI蛋白
• 生物信息学分析
• 抗原表位

目的 利用生物信息学方法对艰难梭菌TPI蛋白的结构和功能进行分析并预测其优势B细胞以及T细胞抗原表位。方法 在NCBI数据库获取TPI蛋白的氨基酸序列；使用ProtParam软件分析蛋白的理化性质；通过Signal 6.0 Sercer和TMHMM 2.0 Sercer软件预测蛋白的信号肽及跨膜区；采用SOMPA和SWISS-MODEL软件分析蛋白的二级结构和三级结构；利用软件ABCpred、IEDB和SYFPEITHI预测TPI蛋白的优势T、B细胞表位。结果 TPI蛋白由247个氨基酸组成，理论pI值5.05;归类于稳定蛋白质，属于亲水性蛋白；不含信号肽序列及跨膜结构域；蛋白的二级结构中α螺旋占52.63%,延伸链占15.38%,β-转角占7.69%,无规卷曲占24.29%;预测该蛋白含有多个优势B细胞及T细胞表位。结论 通过生物学信息的方法预测艰难梭菌TPI蛋白含有多个潜在的B细胞及T细胞抗原表位，为艰难梭菌感染的血清学诊断和亚单位疫苗的研制提供了理论基础。

• 单位
  宁夏医科大学总医院