科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战。富集分析为解决这一问题提出了合理的方案。用Perl语言写了一个脚本——Enrichanalysis.pl,可根据基因注释信息进行基因富集分析,并利用Fisher’s Exact Test做检验。富集分析先根据生物学知识将基因归类,然后进行基因差异表达分析,提高数据的可解释性。并利用3篇SCI文章的差异基因数据,对本perl脚本进行了对比测试,证明本perl脚本算法正确可靠。
-
单位山西农业大学; 生命科学学院; 农业部
