苏云金芽胞杆菌YBT-1520中SigL及其增强子结合蛋白的结构与功能分析

作者：王丽丽; 王阶平; 艾绪露; 周航; 喻子牛; 何进

来源：应用与环境生物学报, 2012, 18(02): 315-319.

• 苏云金芽胞杆菌
• 增强子结合蛋白
• SigL
• 代谢途径
• 功能分析
• 生物信息学
• 表达调控 Bacillus thuringiensis
• enhancer-binding proteins(EBPs)
• metabolism pathway
• function analysis
• bioinformatics
• expression regulation

为揭示SigL及其增强子结合蛋白(EBPs)在苏云金芽胞杆菌(Bt)中的调控功能,在全基因组测序的基础上,采用生物信息学方法,对YBT-1520菌株的SigL及其EBPs的结构和功能进行深入分析.结果表明,YBT-1520基因组中存在1个SigL和6个EBPs,而且EBPs在结构上具有丰富的多样性,包含了EBPs的所有可能的结构域组织类型.SigL所调控的基因涉及11个假定的COG代谢途径,其中包括能量代谢、氨基酸代谢、翻译与细胞周期等.根据EBPs在基因组的位置推测,YBT-1520的EBPs参与γ-氨基丁酸代谢途径、精氨酸代谢途径、支链脂肪酸降解途径、多糖分解代谢等代谢途径的调控.本研究将...

• 单位
  生命科学技术学院; 农业微生物学国家重点实验室; 华中农业大学