四川省广元市胃肠炎暴发中诺如病毒的分子病原学特征研究

作者：侯雪芹; 任敏; 熊丽; 朱俊; 曹冉冉; 马小珍^*

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2019, (01).

• 诺如病毒
• 胃肠炎
• 暴发
• 系统进化分析

目的 了解四川省广元市急性胃肠炎(acute gastroenteritis, AGE)暴发疫情中诺如病毒(Norovirus, NoV)感染情况,明确病原基因型别,并对其基因特征进行初步研究。方法 采集广元市2017年2月至5月4起AGE疫情病例的粪便标本18份、肛拭子标本15份,采用实时荧光RT-PCR检测NoV基因,NoV阳性标本用传统RT-PCR扩增并进一步测序分型。结果 NoV实时荧光RT-PCR结果显示4起疫情均为NoV感染引起的暴发,检测阳性率为60.6%(20/31)。基因序列比对和进化分析结果显示,4起疫情的病原均为GⅡ.P16/GⅡ.2型NoV,且核苷酸高度同源,其中1起除GⅡ.P16/GⅡ.2型外还检出GⅡ.P7/GⅡ.14型NoV。结论 四川省广元市4起AGE暴发疫情主要由GⅡ.P16/GⅡ.2型NoV引起,同时存在GⅡ.P7/GⅡ.14型NoV混合感染。

• 单位
  四川省疾病预防控制中心