小鼠Bex基因家族生物信息学分析

作者:李晋; 曹亚伟; 王业举; 冯荆城
来源:周口师范学院学报, 2020, 37(05): 45-61.
DOI:10.13450/j.cnki.jzknu.2020.05.011

摘要

Bex基因家族广泛分布于哺乳动物基因中,在细胞发育过程中有重要作用.以小鼠Bex基因家族5个成员(Bex1、Bex2、Bex3、Bex4、Bex6)为研究对象,通过生物信息学的研究方法,对该基因家族的基因结构、保守结构域、蛋白质性质进行系统分析,且绘制系统进化树.研究表明,染色体定位显示小鼠Bex基因主要分布在X染色体上(Bex1、Bex2、Bex3、Bex4),Bex6基因位于16号染色体;该家族所有的基因都有3个外显子及一个CDS区;小鼠Bex6基因可能是小鼠Bex4基因转座至16号染色体;有6个保守区域,具有motif 1、motif2、motif 3、motif 4、motif 5、motif 6的定位分别为5、5、5、4、2、2个.6个motif的序列长度存在差异,分别为19、28、23、17、21、8.所有Bex蛋白不稳定,易降解,为亲水性蛋白,脂肪族指数在51.02~61.78之间,没有跨膜结构.Bex基因家族蛋白质等电点均不同,可用等点聚焦电泳区分.Bex蛋白亚细胞定位中,Bex1、Bex2位于细胞质和细胞核,Bex3、Bex4、Bex6位于细胞核.本研究为深入研究Bex基因家族提供理论依据.

  • 单位
    周口师范学院

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