苹果WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族基因的鉴定与分析

作者：王楚堃; 韩朋良; 王咏梅; 王鹏飞^*; 胡大刚^*

来源：园艺学报, 2019, 46(06): 1021-1032.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0716

• 苹果
• WOX家族
• 生物信息学
• 基因表达

利用生物信息学方法和苹果基因组数据库,鉴定并分析了12个苹果WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族基因。系统进化树分析表明,苹果WOX家族和拟南芥WOX家族可被分为现代分支(WUS分支)、中间分支和祖先分支;苹果WOX家族成员均含有1个motif-1,不同分支的成员含有其分支特异的motif;基因结构分析显示,苹果WOX家族基因含有2～4个外显子,染色体定位发现11个基因分别定位在苹果的7条染色体上,1个基因无准确定位。基因表达模式分析表明,12个基因在苹果各组织中均有表达,且在果实中的表达量较高;密码子偏好性分析显示,苹果WOX家族基因的偏好性较弱。

• 单位
  作物生物学国家重点实验室; 山东农业大学; 农业部