山苍子WRKY基因家族鉴定及表达分析

作者：苏文娟; 陈霞; 曹瑞兰; 陈尚钘; 刘洲莹; 刘娟^*

来源：农业生物技术学报, 2022, 30(07): 1290-1302.

• 山苍子
• WRKY基因家族
• 生物信息学分析
• 表达分析

山苍子(Litsea cubeba)是我国南方地区重要的木本香料树种之一，在生长过程中极易遭受生物和非生物胁迫影响。WRKY转录因子在植物生长发育、胁迫应答等过程中发挥着重要作用。本研究基于生物信息学分析，鉴定出41个LcWRKY家族基因，利用转录组数据和qPCR验证，分析并探讨其在不同组织中的表达特异性。系统进化发育显示，LcWRKY家族成员分为2个类群，其中第2个类群包含5个亚类Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e。对LcWRKY基因的保守基序和结构域进行分析，结果证实了系统发育聚类分析的准确性。蛋白互作网络共表达分析表明，LcWRKY36、LcWRKY38和LcWRKY39等处于共线中心，推测其在山苍子响应病害、低磷胁迫等调控过程中起着关键作用。不同组织的转录组分析发现，41个LcWRKY成员在不同组织中差异表达，其中LcWRKY1、LcWRKY3、LcWRKY8等10个基因在根中呈现明显的高表达，LcWRKY8在根中的表达量是叶中的25倍(P<0.01)，推测其在根系发育和逆境胁迫中发挥重要作用。此外，LcWRKY29、LcWRKY10、LcWRKY15、LcWRKY22和LcWRKY1等基因在果实中的相对表达量较高，推测其可能参与山苍子果实柠檬醛等次生代谢产物的生物合成。本研究为进一步解析山苍子WRKY转录因子的功能提供基础资料。

• 单位
  江西农业大学; 江西省森林培育重点实验室