王清任的医学理论重视"气血",无论外感与内伤,皆为"气血病变"。"气"是人体本源,气病独重气虚,疾病多为"气虚"所致;血病多为"血瘀",气不能行血、出血所致"血亏""邪与血结"皆可致"血瘀"。他在组方中倡导"调气活血",创立了以补阳还五汤为代表的一系列著名方剂。