高温胁迫下陆地棉转录组差异性分析

作者：王辉; 董永梅; 郭伟锋; 曹新川; 郭金成; 谢宗铭^*; 何良荣^*

来源：新疆农业科学, 2023, 60(11): 2618-2626.

DOI：10.6048/j.issn.1001-4330.2023.11.003

• RNA-Seq
• 陆地棉
• 高温胁迫
• 差异表达
• 代谢通路

【目的】研究陆地棉高温胁迫下关键基因的响应，比较基因表达差异，为揭示陆地棉高温胁迫响应的分子机制提供参考。【方法】利用RNA-Seq对正常温度(26℃)和高温胁迫(42℃)的陆地棉品系YZ1进行转录组测序和数据分析。【结果】在WN4/WH4,WN12/WH12,WN24/WH24,WN48/WH48共鉴定出383个共有上调基因和234个共有下调基因。将差异基因按GO功能分类，主要富集到上调差异基因和下调差异基因20个类别；差异基因显著富集到类黄酮生物合成途径、苯丙烷代谢、昼夜节律-植物、内质网加工等通路；鉴定出39个转录因子，主要是WRKY和MYB两大家族；Gohir.A08G104100是高温胁迫主要的基因，对植物的耐热性至关重要，Gohir.D08G033300是质体类异戊二烯生物合成的限制酶，对叶绿体发育至关重要。2个差异基因在整个时期表达量差异倍数较为显著。【结论】高温胁迫和正常温度下在不同时间段，陆地棉的基因转录表达差异。

• 单位
  新疆农垦科学院; 塔里木大学