基于BSA-seq法的纤维衣分相关候选基因的鉴定

作者：赵岩; 冯加加; 肖向辉; 黄晋玲; 卢全伟^*; 渠云芳^*

来源：植物遗传资源学报, 2021, 22(06): 1723-1731.

DOI：10.13430/j.cnki.jpgr.20210421002

• 衣分
• BSA-seq
• QTL

衣分是影响棉纤维产量的重要指标。本研究以高衣分棉花陆海渐渗系材料MBI7747-14和中棉所45为亲本,构建包含2403个单株的F2分离群体,挑选衣分性状极端单株构建2个混池,采用BSA-seq方法进行衣分相关基因定位分析。结果表明,在D2染色体上得到4个置信指数高于95%的候选区间,4个区间共包含236个基因,总长度为5.47 Mb。在以上基因中,200个基因中含有SNP,190个基因中含有InDel,其中70个基因含有非同义突变位点。通过转录组数据的基因表达模式分析,筛选出19个可能与衣分相关的候选基因。GO功能富集分析表明,19个候选基因集中于NADP+活性、醛糖醇代谢、碳利用和调控细胞发育等功能条目。本研究为进一步研究棉纤维衣分形成的遗传机制奠定了一定的基础。

• 单位
  安阳工学院; 山西农业大学