铁皮石斛BBS基因家族生物信息学及表达分析

作者:何基泽; 龙小琴; 聂聪; 赵欣宇; 王万军; 朱乾坤*
来源:基因组学与应用生物学, 2022, 41(06): 1329-1338.
DOI:10.13417/j.gab.041.001329

摘要

毛兰素是主要存在于石斛体内的联苄类化合物,其被证实可以通过抑制肿瘤细胞的增殖与迁移以及促进其细胞凋亡来参与多种癌症的治疗。本研究旨在利用生物信息学技术分析铁皮石斛中可能参与毛兰素生物合成的联苄合成酶(bibenzyl synthase, BBS)家族,并克隆其基因进行差异表达分析。结果表明:铁皮石斛(Dendrobium officinale)BBS家族含6个基因成员,分别命名为DoBBS1-6,6个蛋白成员均为亲水性蛋白并都定位于细胞质,其中DoBBS4/6不稳定系数较高,且与其他成员序列相似性较低;逆转录PCR显示DoBBS1-3都在铁皮石斛中有表达,其中高温使三者的表达显著下调,而低温使则其表达上调,另外DoBBS1-3还受到盐、干旱等胁迫影响;组织表达分析显示DoBBS1-3在根茎叶中均有表达,DoBBS1/3表达量低,DoBBS2表达量较高。推测该基因家族受到温度等胁迫的影响进而调节毛兰素等联苄化合物在铁皮石斛中的生物合成。

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