人体胃肠道内存在着大量的微生物,它们被称为人类的第二大基因组——肠道菌群。肠道微生物系统的复杂性和重要性,决定其第二大脑的地位。人体肠道内存在的细菌,不仅参与维持肠道的正常生理功能,更直接影响机体免疫功能。近年来,研究发现肠道菌群与消化道、心血管、神经系统以及代谢等疾病息息相关,现就肠道菌群在疾病中的研究进展做一综述,旨在为临床治疗有提示作用。