通辽市‘塞外红’苹果中三种苹果潜隐病毒的检测及变异分析

作者：张悦东; 孙平平; 李小燕; 杨荣; 王宝侠; 张磊; 李正男

来源：果树学报, 2023, 1-15.

• ‘塞外红’苹果
• RT-PCR
• 苹果褪绿叶斑病毒
• 苹果茎痘病毒
• 苹果茎沟病毒

【目的】明确通辽地区‘塞外红’苹果（Malus pumila）中苹果褪绿叶斑病毒（ACLSV）、苹果茎痘病毒（ASPV）、苹果茎沟病毒（ASGV）等三种苹果潜隐病毒的普遍率和遗传多样性。【方法】从通辽市开鲁县8个乡镇随机采集了96份‘塞外红’苹果枝条，采用RT-PCR法对样品进行三种苹果潜隐病毒检测。对检测为阳性的样品进行病毒基因克隆、测序，并进行序列一致性分析和系统发育分析。【结果】检测结果表明，被检测的‘塞外红’苹果中三种苹果潜隐病毒均有不同程度的发生，并且存在两种或三种病毒的复合侵染。基于CP基因对病毒一致性和变异情况进行分析，结果表明：来源于‘塞外红’苹果的29个ACLSV分离物的核苷酸序列一致性为78.1%～99.9%，与其它15个已知的ACLSV分离物的一致性为69.1%～93.6%；来源于‘塞外红’苹果的12个ASPV分离物的核苷酸序列一致性为83.6%～99.7%，与其他15个已知的ASPV分离物的一致性为75.4%～91.5%；来源于‘塞外红’苹果的21个ASGV分离物的核苷酸序列一致性为96.4%～100.0%，与其它已知的40个ASGV分离物的一致性为89.9%～98.9%。系统发育分析结果表明，44个ACLSV分离物聚集在7个主枝，其中29个‘塞外红’苹果的ACLSV分离物分别位于JB组、Balatonl组、B6组和一个独立分枝；27个ASPV分离物聚集为6枝，其中12个‘塞外红’苹果的ASPV分离物分别位于Ⅰ、Ⅳ、Ⅴ组；61个ASGV分离物聚集为8个枝，其中‘塞外红’苹果的21个ASGV分离物聚集在一起，形成独立分枝。【结论】ACLSV、ASGV、ASPV均能侵染‘塞外红’苹果，并且发生率较高。与其他来源的病毒相比，‘塞外红’苹果的三种病毒分离物，各种内各分离物彼此之间的序列一致性较高并且进化关系较近。研究结果为‘塞外红’苹果产业绿色、健康、持续发展提供基本理论依据。

• 单位
  内蒙古自治区林业科学研究院; 内蒙古农业大学; 园艺与植物保护学院