摘要
目的:探讨加味资成汤防治轻度认知功能障碍(mild cognitive impairment,MCI)的物质基础与作用机制。方法:利用由中国中医科学院中药研究所联合北京大学药学院、中国科学院相关机构构建的中药整合药理学计算平台(TCM-IP,www.tcmip.cn),从中药材数据库获得加味资成汤12味中药的名称、拉丁名、性味归经、产地、功效及其所含化合物等;从中药成分数据库获得12味中药的CAS号、相对分子质量、物理化学性质以及药物代谢性质等信息。在疾病/症状靶标数据库中,以"MCI"作为疾病或症状关键词进行检索,获得治疗"MCI"的药物名称、药物疗效、药物靶标的基因和蛋白质相关信息。采用二维结构相似性搜索(即MACCS分子指纹),开源软件Open Babel提取化学指纹特征,使用Tanimoto系数定义的相似度计量方法,与FDA上市药物进行相似性打分(Score≥0.8),获得加味资成汤作用的潜在靶标,建立药物候选靶标信息数据库。基于加味资成汤药物靶标与MCI之间的相互作用网络,建立加味资成汤靶标-MCI基因互作网络;以"节点连接度(degree)"的2倍中位数为卡值,选取加味资成汤靶标-MCI基因互作网络的核心节点(hubs);在构建关键节点子网的基础上,以"degree"、"节点紧密度(closeness)"和"节点介度(betweenness)"的中位数为卡值,选取同时满足3个卡值的节点为加味资成汤治疗MCI失衡网络的候选靶标;然后,通过对上述加味资成汤候选靶标参与的功能与通路进行富集分析,进一步挖掘加味资成汤缓解MCI关键病理的分子机制,构建"加味资成汤-中药材-化学成分-核心靶标-关键通路"的多层次网络关联图。结果:平台筛选出加味资成汤687种药物化学成分,其中人参的成分数量最多有158种,莲子的成分数量最少仅10种,主要为苷类、糖类、醇类;以及595个治疗MCI的关键靶标,包括羟酰辅酶A脱氢酶三功能多酶复合物亚基α(HADHA)、羟酰-CoA脱氢酶(HADH)、NAD(P)依赖类固醇脱氢酶样(NSDHL)、1-磷脂酰肌醇4,5-二磷酸磷酸二酯酶δ-1(PLCD1)、乙醇脱氢酶1A(ADH1A)、脂肪醛脱氢酶(ALDH3A2)、葡萄糖激酶(GCK)、乙醇脱氢酶1C(ADH1C)、核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶家族成员1(ENPP1)、腺苷酸环化酶2型(ADCY2)等。GO和KEGG富集分析显示这些关键靶标主要定位于细胞质、线粒体,最常见的分子功能是ATP结合、蛋白结合等,并参与嘌呤代谢、核苷酸代谢、碳代谢、碳水化合物代谢等通路。结论:通过该平台能够预测出加味资成汤防治MCI的关键靶标及参与的相关通路,为进一步深入揭示其作用机制奠定了良好基础。
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单位南京中医药大学; 基础医学院