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摘要
为探究乙型脑炎病毒对小鼠脑组织损伤相关基因的变化,本试验采用P3株乙脑病毒感染6周龄BALB/c鼠,取对照小鼠和病毒感染后发病小鼠的脑组织,筛选差异表达基因,并用GO和KEGG数据库进行分析。组织病理学观察见神经元变性坏死,血管周炎性细胞增多及胶质细胞增生;免疫组织化学染色显示大脑皮层神经元细胞内JEV抗原阳性信号显著;脑组织提取RNA后,使用Illumina HiSeqTM平台进行测序,筛选出1 940个差异表达基因,其中表达上调基因1 813个,下调基因127个。GO富集分析显示,差异基因大多与免疫、炎症的调控等途径有关。KEGG富集分析发现,参与免疫过程的差异基因数量最多且富集最显著。显著富集途径有JAK-STAT信号通路、Toll样受体信号通路、NF-κB信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用和TNF信号通路。选取8个差异基因,采用qRT-PCR进行验证,证实和转录组分析结果一致。本研究获得的小鼠感染乙脑病毒后脑的转录组数据,将有助于进一步研究乙脑的发病机制。
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