盐胁迫和ABA处理下水稻基因组的可变剪接事件分析

作者：胡悦; 安硕; 张小砣; 葛晓春^*

来源：复旦学报(自然科学版), 2023, 1-12.

DOI：10.15943/j.cnki.fdxb-jns.20230324.001

• RNA-seq
• 可变剪接
• 盐胁迫
• 脱落酸信号途径

基因的剪接方式在不同发育时期、不同组织以及不同外界环境条件下可以发生改变,即可变剪接。可变剪接在转录后水平上调控基因功能,增加基因功能的复杂性和多样性。目前已发现一些基因在环境因素刺激下会发生可变剪接,但是逆境下全基因组水平上的可变剪接事件在很多植物中还未完全了解,这些事件是否同时受到植物激素的调控目前也不清楚。为了了解水稻在外界逆境胁迫下的全基因组可变剪接事件,特别是脱落酸(ABA)信号途径被激活后哪些基因发生了可变剪接,我们对盐胁迫以及ABA处理后水稻转录组中的可变剪接事件进行了交叉分析,发现一些信号途径的基因在盐胁迫以及ABA处理后均发生了可变剪接。选择其中与DNA损伤修复以及ABA信号转导有关的基因进行了进一步分析,并通过RT-PCR对其中Os PP2C67和Os SADR1基因的可变剪接进行了验证,得到的结果与分析结果一致,未来通过对这些基因的剪接变体的进一步分析将有助于揭示植物响应非生物胁迫的分子机制。

• 单位
  生命科学学院; 复旦大学