枇杷Ty1-copia类反转录转座子RT序列克隆及分析

作者：吴敏芳; 刘厚宇; 文晓鹏^*

来源：中国南方果树, 2019, 48(05): 1-8.

DOI：10.13938/j.issn.1007-1431.20190101

• 枇杷
• 反转录转座子
• Ty1-copia
• 同源性
• 起源与进化

为探索枇杷Eriobotrya japonica基因组进化起源和多样性的关系,本文根据Tyl-copia类反转座子反转录酶(Reverse transcriptase,RT)的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,经过克隆、测序及序列分析,获得了59条来源于枇杷的RT序列。通过系统演化分析,所得核苷酸序列可分为4个群组,序列长度变化范围为241～282 bp,同源性范围为30.8%～100%;编码氨基酸中有17条序列出现终止密码子突变;经反转录转座子RT氨基酸序列比对,枇杷与苹果、李、梅等蔷薇科植物亲缘关系较近。因此,枇杷Ty1-copia类反转录转座子RT序列具有高度异质性,枇杷与蔷薇科物种间有共同起源,而且Ty1-copia类反转座子不仅可以纵向传递,还可在不同类群间横向传递。

• 单位
  贵州大学