二代测序技术在社区获得性肺炎病原学诊断中的应用价值

作者：胡贤珍; 王亚飞; 宋成; 耿爽^*

来源：数理医药学杂志, 2023, 36(04): 261-266.

• 二代测序
• 社区获得性肺炎
• 病原学

目的 研究二代测序（next-generation sequencing,NGS）技术在社区获得性肺炎（community-acquired pneumonia,CAP）病原学诊断中的应用价值。方法 采用回顾性研究方法，选取武汉市中心医院呼吸与危重症医学科2020年12月至2021年8月采用支气管镜检查收集肺泡灌洗液标本并行NGS送检的64例社CAP患者作为研究对象，对其临床相关资料进行分析，比较NGS技术与其他传统病原学检测手段在诊断CAP患者病原体中的差异。结果 64例肺泡灌洗液NGS送检患者中，阳性55例、阴性9例。NGS有41例患者检出细菌27种，传统细菌培养有17例患者检出细菌6种，NGS细菌检出率显著高于传统细菌培养（64.1%vs. 26.6%,P <0.001）。NGS有27例患者检出真菌，传统真菌培养31例检出真菌，NGS真菌检出率与传统真菌培养之间无显著差异（42.2%vs. 48.4%,P=0.48）。NGS检出病毒29例，嗜肺军团菌1例，鹦鹉热衣原体2例，结核分枝杆菌6例，未检出支原体及衣原体；传统病原学检测检出病毒2例，结核分枝杆菌4例，肺炎衣原体2例，未检出鹦鹉热衣原体、嗜肺军团菌、肺炎支原体。结论 NGS可以同时检测细菌、真菌及病毒等非典型病原体，相较于传统病原学检测方法，其检测病原微生物范围广、种类丰富，对CAP患者的病原学诊断具有重要意义，但检出病原体仍需结合临床分析以确定其是否为致病菌。

• 单位
  江汉大学; 武汉市中心医院