基于生物信息学分析DNASE1L3在肝细胞癌中表达及对预后的影响

作者：符赞美; 蔡伟国; 龙清云^*; 卢伟^*

来源：武汉大学学报(医学版), 2023, 1-7.

DOI：10.14188/j.1671-8852.2023.0458

• DNASE1L3
• 肝细胞癌
• 生物信息学分析
• 肿瘤免疫

目的：探究DNASE1L3在肝细胞癌中的表达情况以及对患者预后的影响，并通过生物信息学方法探索其潜在的影响途径。方法：基于TCGA、GSE14520和HPA数据库肝细胞癌数据分析DNASE1L3在正常和肿瘤组织中的表达差异。通过单因素及多因素COX回归分析及Kaplan-Meier生存分析探究DNASE1L3对肝细胞癌预后影响。基于GSE6764数据分析DNASE1L3在肿瘤不同进展时期的表达变化。使用ESTIMATE算法分析DNASE1L3与免疫和基质细胞浸润及肿瘤纯度的关系。使用Limma包对GSVA富集结果进行差异分析，并通过GeneMINIA在线工具挖掘DNASE1L3共表达基因。结果：DNASE1L3在肿瘤组织中表达减低，并且与患者预后不良相关。DNASE1L3在较大的肿瘤、较高的甲胎蛋白（AFP）水平和较晚期的肿瘤组织中的表达水平减低，并且随着肿瘤进展逐步减低。DNASE1L3低表达肿瘤组织中的免疫基质细胞丰度较低，而肿瘤纯度较高，数种免疫检查点基因表达也会增高。富集差异分析及共表达基因富集发现DNASE1L3主要涉及肝细胞癌的DNA损伤修复、细胞周期、脂肪酸代谢、糖酵解等过程，并涉及了免疫细胞浸润的调节过程。结论：DNASE1L3在肝细胞癌组织中低表达，影响肿瘤进展和肿瘤免疫过程，是一种有前途的预后分子标志物及治疗靶点，需要进一步的探索和研究。

• 单位
  武汉大学中南医院