摘要
为探究中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)在蜕壳过程中肠道微生物菌群的演替规律和动态变化。本研究利用16S rRNA高通量测序技术研究了中华绒螯蟹在一个蜕壳周期内(蜕壳前期、蜕壳间期和蜕壳后期)肠道微生物的动态变化规律。结果表明,三个蜕壳时期的肠道微生物优势菌门均为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteriota),其中变形菌门占绝对优势。Alpha多样性指数中的Chao和Sobs丰富度指数在蜕壳后期与间期、前期无显著差异,但Shannon和Simpson多样性指数差异极显著(P<0.01),蜕壳后期的菌群多样性最低而蜕壳间期最高。主坐标(PCoA)分析和ANOSIM检验表明蜕壳后期的肠道菌群与间期、前期均存在极显著差异(P<0.01)。在门水平,变形菌门在蜕壳后期的丰度极显著高于蜕壳间期和前期(P<0.01),而厚壁菌门和放线菌门则是蜕壳间期、前期高于蜕壳后期。在属水平,假单胞菌属(Pseudomonas)与产碱菌属(Alcaligenes)在蜕壳后期丰度最高(P<0.01),表现为从蜕壳后期开始降低,然后在蜕壳前期又上升的趋势。本研究结果表明中华绒螯蟹的肠道微生物与所处蜕壳时期相关,蜕壳会显著影响其肠道微生物的组成和含量,进而影响其生长发育过程。
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