呼吸道合胞体病毒F蛋白二级结构分析及其B细胞表位预测

作者：易高; 潘嘉宇; 林纯意; 刘兆宇

来源：山东医药, 2016, 56(27): 20-23.

• 呼吸道合胞体病毒
• F蛋白
• 蛋白二级结构
• B细胞表位

目的分析呼吸道合胞体病毒(RSV)F蛋白的二级结构并预测其B细胞表位。方法分析RSV F蛋白的二级结构,得出RSV F蛋白中可能出现的信号肽序列以及位置。基于同源建模的方法预测RSV F蛋白的三级结构,以三级结构为基础预测F蛋白中可能存在的构象B表位和线性B表位。结果 F蛋白的574个编码氨基酸中占主要比例的是丝氨酸(10.45%)、亮氨酸(10.28%)、天冬酰胺(8.71%)和苏氨酸(8.71%);可能有7个蛋白结合位点、6个产生螺旋结构的区域;可能存在两个主要的β-折叠片蛋白;F蛋白N-末端第125区段为信号肽。RSV F蛋白头部主要由β-折叠片、无规则卷曲和转角组成,尾部主要由两段长的α-螺旋组成。RSV F蛋白中可能存在4个构象B表位、8个线性B表位。结论 F蛋白编码氨基酸主要为丝氨酸和亮氨酸,可能有7个蛋白结合位点、6个产生螺旋结构的区域、两个主要的β-折叠片蛋白。RSV F蛋白中可能存在4个构象B表位、8个线性B表位。

• 单位
  广州医科大学附属第五医院