MIRU技术在石河子地区部分结核杆菌基因分型聚类分析中的初步应用

作者：张少杰; 陈华强; 马超; 芦孟欣; 周洁; 刘家辰; 姬祥; 陈旭; 刘忠华; 袁俐; 曹旭东^*

来源：石河子大学学报(自然科学版), 2018, 36(05): 581-586.

DOI：10.13880/j.cnki.65-1174/n.2018.05.009

• 结核杆菌
• 基因分型
• 结核杆菌散在分布重复单位

目的采用结核杆菌散在分布重复单位(mycobacterial interspersed repetitive units,MIRU)分型技术,对石河子地区结核杆菌临床分离株进行基因分型及聚类分析,初步筛选可用于石河子地区结核杆菌临床分离株基因分型的MIRU位点。方法以本实验室保存的结核杆菌临床分离株基因组DNA为模板,采用PCR技术与核酸凝胶电泳技术,分别对7个MIRU位点进行检测,计算分辨指数,应用ntsys2.10e软件对菌株基因型进行聚类分析。结果石河子市33株临床分离株有22种基因型,均与结核杆菌标准株(H37Rv)不同;在石河子地区结核杆菌临床分离株的7个MIRU位点中,分辨率高的位点有1个(MIRU26);中等有2个(MIRU10,MIRU16);低的有3个(MIRU23,MIRU39,MIRU40);有一个位点分辨率为0(MIRU27);石河子地区分离株总HGI指数为:0.966。结论本实验选取的7个MIRU位点中有3个(MIRU26,MIRU10和MIRU16)可用于石河子地区结核杆菌临床分离株初步基因分型。

• 单位
  新疆生产建设兵团; 上海市肺科医院; 石河子大学