甘蔗花叶病毒四川分离物的鉴定和遗传变异分析

作者：李明骏; 钟源; 廖豪杰; 吴根土; 青玲^*

来源：西南大学学报(自然科学版), 2023, 45(02): 45-53.

DOI：10.13718/j.cnki.xdzk.2023.02.006

• 甘蔗花叶病毒
• 玉米
• 甘蔗
• 病毒检测
• 遗传变异

玉米和甘蔗是西南地区两种重要的禾本科农作物，而病毒病的常年发生严重威胁着玉米和甘蔗的生产.从四川攀枝花田间采集表现花叶、褪绿、斑驳或矮化等病毒病症状的玉米样品54份和甘蔗样品42份，用小RNA深度测序结合反转录聚合酶链式反应进行病毒检测，以明确引起该地区玉米和甘蔗病毒病的病原.结果显示：从玉米病株上检测到甘蔗花叶病毒(sugarcane mosaic virus, SCMV)、玉米黄花叶病毒(maize yellow mosaic virus, MaYMV)和留尼旺玉米线条病毒(maize streak Reunion virus, MSRV), 3种病毒的检出率分别为66.7%, 59.3%和3.7%;从甘蔗病样中检测到SCMV(52.4%)、甘蔗瓜德罗普杆状病毒A(sugarcane bacilliform Guadeloupe A virus, SCBGAV)(76.2%)和高粱花叶病毒(sorghum mosaic virus, SrMV)(28.6%).鉴于SCMV在玉米和甘蔗田间样品中的高检出率，利用其外壳蛋白基因对SCMV四川分离物的遗传变异进行综合分析.系统发育分析表明：120个SCMV中国分离物被分为5组，且其进化分组表现出宿主和地理起源的相关性，来源于玉米的SCMV四川分离物主要被聚入C组，而来源于甘蔗的SCMV四川分离物被聚入E组.核苷酸多样性分析表明：来源于玉米和甘蔗的SCMV四川分离物群体间变异度较高.FST测试表明：四川和云南两地SCMV群体间存在频繁基因流，且群体统计分析结果显示SCMV四川和云南分离物群体存在潜在的扩张趋势.该研究是对四川玉米和甘蔗上病毒病原的综合鉴定，也是对SCMV四川分离物遗传变异情况的首次报道，为SCMV病毒病的防控提供了重要参考依据.

• 单位
  西南大学