蛋白质组学分析肾透明细胞癌中的乙酰化蛋白质

作者：黄思博; 孙月; 梁钧泽; 高桂彬; 梁晓玲; 钟利叶; 方润东; 汪洋^*; 黄盛玲^*

来源：中国病理生理杂志, 2020, 36(11): 1996-2004.

• 肾透明细胞癌
• 定量乙酰化蛋白质组学
• 谷胱甘肽硫转移酶κ1

目的:为探究蛋白质乙酰化在肾透明细胞癌(ccRCC)中的角色,本研究采用乙酰化搜库策略,分析ccRCC临床组织样本的质谱数据,全面鉴定ccRCC相关的乙酰化蛋白、乙酰化位点及差异表达蛋白,并分析其所参与的信号通路,为寻找临床诊断的分子标志物及治疗靶点提供信息。方法:通过检索ProteomeXchange质谱数据库,筛选8对ccRCC和癌旁组织样本数据。通过不同的搜库策略鉴定分析差异表达蛋白及乙酰化蛋白,利用聚类分析、GO富集分析、KEGG通路分析等生物信息学手段对差异蛋白进行深入探讨,并应用Western blot技术对3对ccRCC及癌旁组织中的蛋白乙酰化水平进行验证。结果:本次质谱数据挖掘,总共鉴定到464个差异蛋白,其中上调蛋白104个,下调蛋白360个。通过GO富集和KEGG通路分析发现,上调蛋白主要参与了血管收缩、补体和凝血级联系统、血小板激活等过程。另外,我们鉴定到乙酰化蛋白503个,包含乙酰化位点1 397个,与癌旁组织相比,8组ccRCC组织中的蛋白乙酰化水平均显著下调。Western blot实验确证ccRCC组织中的乙酰化蛋白水平较癌旁组织显著减少。从乙酰化质谱鉴定结果中,我们发现谷胱甘肽硫转移酶κ1(GSTK1)蛋白的K158、K163和K165位点乙酰化水平在ccRCC中显著下降。结论:补体与凝血级联、血管收缩、血小板激活等相关蛋白可能参与ccRCC的发生发展过程。ccRCC中蛋白的乙酰化水平总体下降,其中GSTK1的去乙酰化可能是ccRCC恶性进程的关键分子事件,有作为潜在的临床生物标志物的可能性。

• 单位
  暨南大学附属第一医院; 暨南大学