摘要
目的 基于网络药理学及分子对接法探索白及三七药对修复糖尿病足(DF)的作用机制。方法 采用中药系统药理学分析数据库(TCMSP)、SymMap数据库和BATMAN-TCM数据库筛选白及、三七的化学成分和作用靶点;通过检索毒性与基因比较数据库(CTD)、人类孟德尔遗传研究平台(OMIM)和人类基因信息数据库(GeneCards)选取DF靶点并筛选药物与疾病共同靶点;用UniProt数据库对疾病和药物靶点进行标准化命名,并使用STRING平台构建蛋白质间相互作用网络(PPI),利用cytoHubba插件选出排名前30的Hub基因;利用Cytoscape 3.6.0软件构建药物-成分-靶点网络图;利用cluster profile R包对核心靶点进行基因本体(GO)富集分析,京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行通路富集分析;运用AutoDock Vina对核心活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 从白及三七药对中得到了102个主要活性化合物,164个药物-疾病共有靶点,主要活性化合物为槲皮素、鬼伞菌素,邻苯二甲酸二正辛酯、3,4-二甲基苯甲酸、棕榈酸等;核心靶点主要为白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤抑制蛋白(TP53)、白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子(TNF)、一氧化氮合酶3(NOS3)、胰岛素样生长因子1、人内皮素1、趋化因子2等;GO富集分析得到5 597条生物过程,KEGG富集分析得到273条信号通路,主要涉及AGE-RAGE、MAPK、HIF-1等信号通路;分子对接结果显示核心活性成分与核心靶点之间具有较好的结合能。结论 白及三七药对中的槲皮素、鬼伞菌素、邻苯二甲酸二正辛酯、3,4-二甲基苯甲酸等活性成分可能通过调节TNF、TP53、NOS3、IL-6等蛋白,作用于AGE-RAGE、MAPK、HIF-1等信号通路,发挥抑制炎症反应、促进细胞增殖分化、抗细胞凋亡、促血管内皮生成、参与免疫调节等作用,从而达到修复DF的效果。
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单位陕西中医药大学附属医院; 陕西中医药大学