缺氧微环境对多发性骨髓瘤转录组和预后的影响及其治疗策略研究

作者：李颖; 郑蓓; 蒋慧芳; 应茵; 韩冰; 张美玲; 汪一帆; 王强凤; 李功华^*

来源：中国现代应用药学, 2021, 38(02): 148-155.

DOI：10.13748/j.cnki.issn1007-7693.2021.02.004

• 多发性骨髓瘤
• 缺氧
• 肿瘤微环境
• 转录组
• 生物信息学

目的利用生物信息学的方法分析肿瘤缺氧微环境对多发性骨髓瘤(multiplemyeloma,MM)转录组的影响,筛选差异基因,为探索细胞耐受缺氧环境的分子机制提供信息。方法从GEO数据库获得缺氧培养下的MM细胞株以及患者骨髓来源CD38阳性细胞的表达谱芯片,利用Limma包分析缺氧环境下一致性较好的差异基因,对这些差异基因进行GO和KEGG分析,并用TCGA数据库研究其表达水平与MM患者生存的关系。最后利用差异基因预测抑制缺氧微环境的潜在药物。结果针对2种数据集共筛选得到28个一致性较好的差异基因,这些基因主要参与细胞代谢途径、线粒体结构、自噬等,这可能与MM的缺氧耐受有关。生存分析显示:ANXA1、CLU、DPYSL3、CEP128、DDIT4、HMGCS1基因的高表达导致MM患者预后变差。CMAP分析提示PARP抑制剂可抑制缺氧相关信号通路。结论本研究利用生物信息学手段筛选得到了缺氧影响MM的差异基因,发现其中部分基因的高表达可导致MM患者预后变差,这可能与缺氧环境导致肿瘤细胞生存增强有关。PARP抑制剂可能成为缺氧抑制剂,与其他化疗药物联合使用实现更好的治疗效果。

• 单位
  浙江大学医学院附属第一医院; 浙江省立同德医院