颈动脉粥样硬化差异表达基因HMGB1、CCL3、 CCL3L1、CCL4和DUSP1的验证

作者：陈举海; 许逢燕; 张书萍; 王明栋; 金欣; 莫显刚^*

来源：国际检验医学杂志, 2023, 44(17): 2080-2085.

• 颈动脉粥样硬化
• 特征基因
• 转录因子
• 竞争性内源RNA

目的 验证颈动脉粥样硬化(CAS)的差异表达基因高迁移率族蛋白B1(HMGB1)、趋化因子(C-C-基元)配体3(CCL3)、趋化因子(C-C-基元)配体3样蛋白1(CCL3L1)、趋化因子(C-C-基元)配体4(CCL4)和双特异性磷酸酶1(DUSP1)。方法 收集CAS患者和健康者的外周全血，提取单核细胞样本，通过采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测CAS特征基因表达谱。最后，利用NetworkAnalyst、miRWalk和StarBase数据库构建特征基因的转录因子(TFs)调控网络和竞争性内源RNA(ceRNA)网络。结果 与健康者相比，HMGB1 mRNA相对表达量在CAS患者中高表达，CCL3、CCL3L1、CCL4、DUSP1 mRNA相对表达量在CAS患者中低表达。随后，构建了4个特征基因(CCL4、CCL3、DUSP1和HMGB1)相关的142个TFs组成的TFs调控网络和85个ceRNA为中心的ceRNA网络。结论 HMGB1、CCL3、CCL3L1、CCL4和DUSP1可作为CAS的特征基因。

• 单位
  贵州医科大学