宏基因组二代测序技术在儿童重症肺炎病原学诊断中的应用价值研究

作者：周焱; 周欣; 齐旭升^*

来源：中国现代药物应用, 2023, 17(13): 84-88.

DOI：10.14164/j.cnki.cn11-5581/r.2023.13.024

• 宏基因组二代测序
• 传统病原学检测
• 重症肺炎
• 支气管肺泡灌洗液

目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在儿童重症肺炎病原学诊断中的应用价值。方法 回顾性分析71例重症肺炎患儿的临床资料,均进行m NGS检测及传统病原学检测(TPD)。比较m NGS与TPD病原体及细菌检测结果 ,并分析m NGS细菌检测阳性的影响因素及TPD细菌检测阳性的影响因素。结果 71例患儿经m NGS病原体检测阳性66例,阳性率为93.0%;TPD病原体检测阳性51例,阳性率为71.8%。两者病原体检测结果一致性较差(Kappa=0.234), mNGS病原体检测阳性率显著高于TPD,差异具有统计学意义(P=0.001<0.05)。TPD细菌检测阳性率为38.0%(27/71),培养时间为(79.2±15.7)h;mNGS细菌检测阳性率为67.6%(48/71),检出时间为(54.0±16.9)h。两者细菌检测阳性率一致性较差(Kappa=0.299), mNGS细菌检测阳性率显著高于TPD,检出时间显著短于TPD,差异均有统计学意义(P<0.05)。71例患儿经mNGS细菌检测阳性48例(67.6%)作为mNGS阳性组,阴性23例(32.4%)作为mNGS阴性组；mNGS阳性组的月龄5.5(2.3, 18.8)个月显著小于阴性组的18.0(3.0,54.0)个月,白细胞计数(WBC)13.2(8.5, 18.6)×109/L、血小板计数(PLT)(466.2±258.7)×109/L显著高于m NGS阴性组的9.6(5.7, 13.8)×109/L、(295.7±192.1)×109/L,差异均有统计学意义(P<0.05)；两组性别、血红蛋白(Hb)、乳酸脱氢酶(LDH)、降钙素原(PCT)、抗生素使用率、氧合指数、先天性心脏病发生率、机械通气率、PICU住院天数、治愈出院率比较差异均无统计学意义(P>0.05)。71例患儿经TPD细菌检测阳性27例(38.0%)作为TPD阳性组,阴性44例(62.0%)作为TPD阴性组；TPD阳性组的抗生素使用率55.6%(15/27)显著低于TPD阴性组的81.8%(36/44), WBC13.5(10.8, 22.5)×109/L显著高于TPD阴性组的10.0(6.1, 14.6)×109/L,差异均有统计学意义(P<0.05)；两组性别、月龄、Hb、PLT、LDH、PCT、氧合指数、先天性心脏病发生率、机械通气率、PICU住院天数、治愈出院率并比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 mNGS可显著提高重症肺炎病原体的检出率,对临床治疗有指导作用,且受抗生素使用的影响较小。

• 单位
  十堰市太和医院; 锦州医科大学; 湖北医药学院