病毒蛋白质结构属于医学微生物学的教学难点问题。为突破难点,我们以呼吸道病毒的蛋白质结构和变异为核心,将生物信息学中的序列检索、比对、蛋白质结构同源建模,与进化轨迹可视化等知识紧密结合。线上以流感病毒为例讲解每个环节的操作流程,学生根据指导书对腺病毒和新冠肺炎病毒进行分析。线下讨论课形式由学生汇报分析结果,该教学设计在实践中取得了良好的效果和反馈,是新冠疫情背景下线上线下进行教学的有益探索。